Meskipun Quinella—paus agung Gereja Axiom—keadaan tampaknya belum tenang. Setelah menghubungi dunia nyata, Kazuto “Kirito” Kirigaya mengetahui bahwa Penyu Laut—sebuah mega-pelampung yang dikendalikan oleh Rath—telah diserbu. Karena korsleting tiba-tiba yang disebabkan oleh para penyerbu, fluctlight Kirito rusak, membuatnya koma. Merasa tidak aman dengan orang-orang di Gereja Axiom, Alice membawa Kirito yang tidak sadarkan diri kembali ke kampung halaman mereka—Desa Rulid, mengabaikan pengusirannya karena kejahatan yang belum terselesaikan. Sekarang, Alice menjalani kehidupan yang biasa dan damai di dekat desa, berharap Kirito bangun.
Namun, tragedi terjadi ketika Alice menyadari bahwa Wilayah Kegelapan telah mulai menyerang Kekaisaran Manusia. Dengan menggunakan kembali alias sebelumnya, Alice Synthesis Thirty, ia berjanji untuk mengalahkan Dark Territory demi mempertahankan dunia yang telah Kirito dan Eugeo kerja keras untuk lindungi.
[Written by MAL Rewrite]